设置多类别的复制比要求。高校应针对不同种类、不同学历层次的学位论文设置不同的复制比要求。应用技术方面的学位论文中文字描述的部分偏少，复制比要求应稍稍提高；基础理论方面的学位论文中文字描述的部分偏多，复制比要求应稍稍降低。硕士学位论文字数少，复制比要求应稍有提高；博士学位论文字数多，复制比要求应稍有降低。
高校还可以依据学位论文的不同部分，设置不同复制比¨1|。杂志社针同样可以对不同类型的学术论文，设置不同复制比，例如综述类论文，复制比要求应降低。论文查重结果仅作为评判学术论文质量的参考指标。对于学位论文而言，高校中负责论文查重的部门应与院系合作，对复制比高的学位论文进行人工复查，并得出终结果。
对于期刊论文而言，杂志社也需采取相同的措施。在复查过程中，杂志社工作人员将论文查重结果作为参考指标，并结合对全文观点的审查，终判断出论文质量高低或是否存在学术不端行为[10]。对于复制比高，但论点新颖、逻辑性强、数据真实的学术论文，不宜采取退稿处理的方式。
改善检测结果的申诉机制。高校应配备专门部门来处理检测结果的申诉。由于高校的论文查重具有时段性的特点，该部门的人员构成以兼职人员为主。杂志社的论文查重具有长期性的特点，需配备专职人员来处理作者的申诉。工作量大的时候，可适当增添兼职人员辅助专职人员的工作。
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